２種類のメッセージを用意します。（仮にメッセージA、メッセージBとします）
「アプリ」「期間」「位置情報」「カテゴリ」「端末名」「OSバージョン」等の条件でセグメントを選択し、２つのグループにわけてメッセージAとメッセージBを通知します。

メッセージA、メッセージBのそれぞれに通知履歴が作成されますので、それぞれの起動数確認することでどちらの通知の方が効果が高かったのか確認する事ができます。
また、同じメッセージでも別の時間に通知を送る事ができますので、メッセージの違いだけでなくどの時間に送った方が効果が高いのかという通知の配信時間によるABテストを行うことも可能です。